近日，我校信息科学与工程学院研究生和树天同学以第一作者身份在《Nucleic Acids Research》database issue（JCR一区，影响因子16.6）在线发表了题为“PlantCircRNA: A comprehensive database for plant circular RNAs”的研究论文，其导师孙晓勇教授为本文唯一通讯作者。

环形RNA(Circ RNAs)是一种特殊类型的非编码RNA，是由3′端下游供体和5′端上游受体经反向剪接形成的闭合环状分子，普遍存在于真核生物中。CircRNAs结构稳定，具有重要的非编码功能，在调节基因表达和各种生物学功能方面起着重要作用。CircRNAs在植物体内也起着重要的调控作用，影响植物的根、茎、叶、花、果实以及其他器官生长发育。为进一步系统研究植物环形RNA，该团队对94种植物进行了系统的分析挖掘，构建了一个目前世界最大的植物环形RNA数据库：PlantCircRNA。

PlantCircRNA是一个涵盖了94种植物的大数据平台。该平台对39,245 RNA-seq 样品进行了分析挖掘，提取了相关环形RNA数据，并整合了课题组前期构建的AtCircDB和CropCircDB。针对组织特异性和各类胁迫，平台都进行了系统的标注和梳理。依据81篇文献，平台对已经发现的环形RNA做出进一步标注，并验证了detection score算法支持数据的可靠性。作为目前最为全面的植物环形RNA大数据平台，PlantCircRNA对研究植物环形RNA具有重要的应用价值。

该研究得到了国家自然科学基金面上项目的资助，山东农业大学高性能计算中心提供了算力支持。论文链接：https://doi.org/10.1093/nar/gkae709

和树天：山东农业大学信息科学与工程学院2022级硕士研究生，导师为孙晓勇教授，研究方向为生物信息学，目前以第一作者身份在《Nucleic Acids Research》期刊发表论文1篇，以合作作者身份发表EI会议论文1篇。

孙晓勇：山东农业大学信息学院教授，硕士生导师。国家基金委通讯评审专家，获国家自然基金面上项目和联合基金资助。在国内外学术刊物发表论文23篇，其中被SCI收录17篇，包括《Plant Physiology》,《Briefings in Bioinformatics》,《Molecular Plant》,《Journal of Clinical Investigation》等国际知名期刊，发表论文被引用1000余次，授权专利11项，独立出版专著1部，并任国际主流期刊：《Bioinformatics》，《Briefings in Bioinformatics》等审稿专家。主要研究方向为基因组学和表型组学。